从最初坚持要采取高道德标准，把遭到检方贪污罪行起诉者都视为妖魔鬼怪，一律不予提名参选公职的法匠性格，转而到突破国民党党章藩篱、将参选权与一审判决切割处理的宽松主张，马英九个人心态的调整，与自己所牵涉司法案件的发展进度可说是息息相关。

先前台南地检署针对”双许案“中、有关半数不必单据支领“特别费”、所做成的部分不起诉处分书，曾经强力鼓舞马英九阵营士气，认为马案一审判决几乎笃定胜券在握。不过，近来眼见民进党强力杯葛”中选会组织法”修正案、司法体系处理邱毅所涉案件的粗糙作为，以及执政者调动检察人事的粗暴无理，又开始让马英九对于“特别费”案审理结果转趋保留与悲观。

套句马英九过去对于红衫军倒扁行动的比喻，现在马英九眼里的“特别费”案，“既是法律问题，更是政治问题”，绝对不能再任凭难以信任的司法体系，操弄自己的政治前途，甚至让扁当局透过司法手段，形成另类的“两颗子弹”选举效应。所以马英九才大幅退守到“即使一审有罪仍要参选到底”，以免成了被自己虚拟高道德绳索所捆绑的待宰羔羊。

不过，马英九的个人决定，显然也将挑起外界对国民党要求参选公职道德标准认知“昨是今非”的质疑，甚至引起国民党内有意竞逐“总统”的不同势力的非议责难，未来国民党势将无可回避地要去面对夹杂在“务实执政”与“理想廉洁”间的两难。当马英九决定出手推掉阿扁恣意伸入司法体系的黑手时，也得开始担忧，自己的双手，会不会因此被抹黑了。