潘锡堂接受中评社专访时指出，马英九“执政”后，两岸关系有大幅的改善，最重要的是在“九二共识”的前提下，恢复两岸制度化谈判，在海基会和海协会机制下恢复两岸不同层次的谈判。

他说，李登辉主政的13年，两岸关系最好的就是海基、海协两会制度化谈判的时期，两岸谈判的三个主要议题，虽然没有签署协议，但都每次会谈的主议题，分别是偷渡客遣返、劫机犯遣返和海上遇事纠纷。马英九“执政”后，两岸可以谈的议题很多，最迫切要谈的是客运包机周末化和常态化的实现，透过协商谈判，加速两岸客运包机从周末化到常态化，常态化是两岸每天都有飞机对飞，马英九“执政”后可能三四个月就实现，与此同时，马英九同步的要推动的是直航，直航牵涉到航线定位的问题，航权的谈判，要花比较多的时间，也比较复杂，这里头某程度上要搁置一些争议，才谈得出来。

潘锡堂指出，马英九作风是满务实的，而且国民党有一支很有谈判经验的团队，人才很多，按马英九原来的规划，在他就职后，就马上展开直航的谈判，预计一年内谈成，谈成了签置协议并落实。周末包机迈向常态化包机，固然对于台商台眷往返方便，但直航是攸关两岸人员货物的往来，可以密切化两岸经贸往来，更可以强化台湾的经济竞争力。

他说，过去就是因为两岸没有直航，所以台湾这几年的竞争力一直下降，很多外商外资都不愿意进入台湾，有的还撤走了。他又认为，马英九上台后，两岸包机算是小Case，重要的是两岸经贸正常化，两岸经贸没有正常化，是因为没有三通直航，只要马主政后一年内完成协商，签署协议并实行，这样两岸经贸关系就能正常化。

潘锡堂指出，马英九上台比较能大开大阖，就是改善两岸关系。国民党当局未来推动的就是更为开放、更有前瞻性的两岸经贸关系，包括开放陆资入台，不管投资房地产还是商业办公室，开放台湾金融机构到大陆设分行。还有两岸交流的速度加快，还有两岸新闻媒体在对于大城市长期驻点，还有的是分阶段承认大陆学历，可能先承认72所重点大学，第一阶段承认72所大学里的理工医农，第二阶段是商管，第三阶段是政治文史哲。